新普京

    新普京官网研究方案

扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域,通过检测目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。

技术优势

1、通量高,适用于大量样本的特定基因组区域研究
2、周期短,可缩短研究周期,加速临床应用及文章发表
3、信息度高,针对感兴趣的基因组区域进行遗传变异位点的寻找,可对特定区域进行深入研究

实验路线

  • 样品准备
  •  
  • DNA提取与检测
  •  
  • PCR扩增
  •  
  • 产物纯化
  •  
  • 文库制备与产检
  •  
  • Hiseq上机测序

生物信息学分析

应用领域

环境微生物、肠道微生物、发酵微生物菌群研究等

样品要求

样品类型 样品量 样品要求
常见环境样本 土壤、淤泥、沉积物 ≥3g 建议使用5ml EP 管进行装载
粪便 ≥500mg 详情咨询
水样(过滤后的滤膜拭子) ≥2个 最适滤膜直径3-4cm,孔径大小一般选择0.22um或者0.45um
组织样本 肠道组织等 ≥1g 详情咨询
DNA/PCR产物 DNA(浓度≥5ng/ul) ≥150ng DNA要有明显主带,无降解,无RNA、蛋白质等杂质污染
PCR产物(浓度≥20ng/ul) ≥400ng 片段大小<450bp,条带单一,无降解,无引物二聚体